1、含义不同：
全日制研究生是指符合国家研究生招生规定，通过研究生入学考试或者国家承认的其他入学方式，被具有实施研究生教育资格的高等学校或其他教育机构录取，在基本修业年限或者学校规定年限内，全脱产在校学习的研究生。
非全日制研究生指符合国家研究生招生规定，通过研究生入学考试或者国家承认的其他入学方式，被具有实施研究生教育资格的高等学校或其他教育机构录取，在学校规定的修业年限(一般应适当延长基本修业年限)内，在从事其他职业或者社会实践的同时，采取多种方式和灵活时间安排进行非脱产学习的研究生。
2、毕业证书有所不同：
非全日制和全日制研究生毕业时，按照国家有关规定发给相应的、注明学习方式的毕业证书。也就是说选择非全日制研究生学习，毕业所获得的毕业证书标有“非全日制”字样。
3.考试内容、考试形式、考试时间
全日制研究生考试内容除政治英语统一外，其他为数学或专业课，考试时间一般为每年的12月中下旬;在职研究生考试形式主要有两种即五月份同等学力申硕和一月份统考，五月份同等学力申硕一般考外语和专业综合，一月份统考依据专业不同考试内容也不尽相同。考试时间分别为五月份和12月份。
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