华北水利水电大学自1965年开始招收培养研究生，研究生院负责全校研究生教育和学科建设工作，主要职责为：组织学校研究生教育的改革，参与有关学校发展问题的决策，开展研究生教育研究工作;据国家计划、科技发展、社会需要和可能条件，研究制订学校研究生教育发展的中长期规划和年度招生计划;制订研究生教育的各项规章制度，做好研究生教育管理的日常工作，遴选研究生指导教师，加强研究生管理干部队伍建设，对研究生教育和学位授予质量进行检查和评估;加强学科建设，参与制订学校学科建设规划，调整和优化学科结构，促进新兴学科、交叉学科和高新技术的发展;统一管理有关研究生教育的各种经费，参与确定学校涉及研究生教育的建设项目和经费预算;承担上级部门和学校委托的其他工作。

　　研究生院共设有综合办公室、教育管理科(研工部办公室)、质量保障与评估科、研招科、就业指导科、培养科、学位管理科、重点学科建设科八个科室。

　　学校1981年获得国家首批硕士学位授予权，是河南省硕士学位授予类型较为齐全的高等院校，2009年成为博士学位授予立项建设单位，2014年开始招收培养博士研究生。是国务院学位委员会授权的、河南省唯一具有单独命题考试资格招收优秀在职人员攻读硕士学位(双证齐全)的地方院校;河南省唯一具有"少数民族高层次骨干人才计划"招收攻读硕士研究生资格的院校;具有推荐应届本科毕业生攻读硕士研究生和接收免试推荐硕士研究生资格。

　　学校目前共有水利工程、地质资源与地质工程、管理科学与工程三个博士学位一级学科点;水利工程、地质资源与地质工程、机械工程、动力工程及工程热物理、控制科学与工程、计算机科学与技术、土木工程、农业工程、数学、管理科学与工程、工商管理、软件工程12个硕士学位一级学科点;58个硕士学位二级学科点;有工程硕士、工商管理硕士和农业推广硕士3个专业学位类别，水利工程、地质工程、农业工程、机械工程、项目管理、建筑与土木工程、动力工程、控制工程、计算机技术、工业工程、物流工程、农业机械化和农业信息化等14个专业学位领域;13个一级学科省级重点学科，1个二级学科省级重点学科。

　　学校现有在学博士、硕士研究生2100余人。