制药工程专业考研方向较多，包括药物合成与工艺、药物分析、药剂学、生物制药、制药工程与工艺、药事管理等。以下是一些建议的考研方向和院校：

　　1. 药物合成与工艺

　　研究方向：药物合成、药物设计、反应机理、绿色合成方法、药物制备工艺等。

　　学校推荐：

　　清华大学

　　北京大学

　　中国药科大学

　　复旦大学

　　上海交通大学

　　浙江大学

　　2. 药物分析

　　研究方向：药物分析、分析方法开发、质量控制、药物代谢、药物检测等。

　　学校推荐：

　　清华大学

　　北京大学

　　中国药科大学

　　复旦大学

　　上海交通大学

　　浙江大学

　　3. 药剂学

　　研究方向：药物递送系统、靶向给药、药物新剂型、制剂工艺、生物利用度等。

　　学校推荐：

　　清华大学

　　北京大学

　　中国药科大学

　　复旦大学

　　上海交通大学

　　浙江大学

　　4. 生物制药

　　研究方向：生物技术药物、基因工程、细胞工程、发酵工程、生物制药工艺等。

　　学校推荐：

　　清华大学

　　北京大学

　　中国药科大学

　　复旦大学

　　上海交通大学

　　浙江大学

　　5. 制药工程与工艺

　　研究方向：制药工艺优化、工程设计、质量管理、清洁生产、制药设备等。

　　学校推荐：

　　清华大学

　　北京大学

　　中国药科大学

　　华东理工大学

　　天津大学

　　西安交通大学

　　6. 药事管理

　　研究方向：医药政策、医药市场、药品注册、知识产权、药物经济学等。

　　学校推荐：

　　清华大学

　　北京大学

　　中国药科大学

　　复旦大学

　　上海交通大学

　　浙江大学

　　在确定考研方向和学校时，请充分了解各学校的专业特色、师资力量、科研环境和就业情况，以便找到最适合自己的考研目标。此外，关注招生简章、考试大纲和参考书目，认真准备考试。